La bandera de Aguas Buenas fue confeccionada por el Sr. Francisco “Paquito” Díaz en el 1975. La bandera se compone de un rectángulo dividido en tres franjas, en el lado izquierdo un triángulo azul con la estrella solitaria representando nuestra nacionalidad puertorriqueña, luego aparece el triangulo amarillo y otro color verde, expresa nuestra agricultura, flora tropical y el desarrollo comercial e industrial.